保稅區(qū)儲(chǔ)受到海關(guān)的直接，雖然說貨物也是由存貨人委托保管，但保管人要對(duì)海關(guān)負(fù)責(zé)，入庫(kù)或者出庫(kù)單據(jù)均需要由海關(guān)簽署。保稅區(qū)儲(chǔ)一般在進(jìn)出境口岸附近進(jìn)行。

貨物在倉(cāng)庫(kù)中的全周期需要能夠?qū)崟r(shí)掌握，因此保稅區(qū)儲(chǔ)的管理信息系統(tǒng)要求也高很多。

2．保稅區(qū)儲(chǔ)貨物簡(jiǎn)單加工
（1）保稅區(qū)庫(kù)申請(qǐng)對(duì)保稅區(qū)儲(chǔ)貨物進(jìn)行改變包裝、分級(jí)分類、加刷嘜碼、分拆拼裝等簡(jiǎn) 單加工，須事先填制《保稅區(qū)儲(chǔ)貨物簡(jiǎn)單加工申請(qǐng)表》向主管海關(guān)提出。
（2）主管海關(guān)審核后，在《保稅區(qū)儲(chǔ)貨物簡(jiǎn)單加工審核表》“海關(guān)審核意見”欄批注是否準(zhǔn)予開展簡(jiǎn)單加工業(yè)務(wù)的意見，并簽發(fā)給企業(yè)。
（3）保稅區(qū)庫(kù)須在對(duì)倉(cāng)儲(chǔ)貨物簡(jiǎn)單加工完成后3個(gè)工作日內(nèi)，在《保稅區(qū)儲(chǔ)貨物簡(jiǎn)單加工審核表》加注加工情況，交回主管海關(guān)。
3．保稅區(qū)儲(chǔ)貨物存放期限
（1）保稅區(qū)儲(chǔ)貨物儲(chǔ)存期限為一年，儲(chǔ)存期限滿后，有正當(dāng)理由的，可向主管海關(guān)申請(qǐng)延期，延期長(zhǎng)不得超過一年。
（2）辦理延期手續(xù)應(yīng)遞交單證：
a．延期倉(cāng)儲(chǔ)協(xié)議；
b．《保稅區(qū)儲(chǔ)貨物延期倉(cāng)儲(chǔ)申請(qǐng)表》。
（3）經(jīng)海關(guān)審核準(zhǔn)予延期的，海關(guān)簽發(fā)《保稅區(qū)儲(chǔ)貨物延期倉(cāng)儲(chǔ)審核表》。
（4）對(duì)超過規(guī)定的存儲(chǔ)期限三個(gè)月仍不復(fù)運(yùn)出境，也不辦理有關(guān)進(jìn)境手續(xù)的，海關(guān)依法變賣處理。

保稅區(qū)儲(chǔ)區(qū)別于一般倉(cāng)儲(chǔ)之處在于保稅區(qū)儲(chǔ)的力度要大得多。貨物在倉(cāng)庫(kù)中的全周期需要能夠?qū)崟r(shí)掌握，因此保稅區(qū)儲(chǔ)的管理信息系統(tǒng)要求也高很多。庫(kù)存信息化通過庫(kù)存物品的入庫(kù)、出庫(kù)、移動(dòng)和盤點(diǎn)等操作對(duì)企業(yè)的物流進(jìn)行全面的控制和管理，能夠降低庫(kù)存，減少資金占用，杜絕物料積壓與短缺現(xiàn)象，提高服務(wù)水平，保證生產(chǎn)經(jīng)營(yíng)活動(dòng)的順利進(jìn)行。
自主管理的保稅區(qū)儲(chǔ)物流企業(yè)，必須通過海關(guān)的嚴(yán)格審核才能營(yíng)運(yùn)。首先，自主管理的保稅區(qū)物流企業(yè)必須有很好的管理體系，還要有很好的誠(chéng)信度，確保國(guó)家關(guān)稅的征收，決不，保稅貨物的物流過程必須符合中國(guó)海關(guān)管理規(guī)范，嚴(yán)格執(zhí)行海關(guān)進(jìn)出口報(bào)關(guān)規(guī)則；其次，自主管理的保稅區(qū)物流企業(yè)必須能為貨主提供高質(zhì)量的、符合要求的物流服務(wù)，其中包括能嚴(yán)格按照貨主的要求進(jìn)行備件的保管、存儲(chǔ)、包裝、配送、回收和退換，保證維修備件能正確、快捷、準(zhǔn)時(shí)、保質(zhì)地送達(dá)貨主手中。
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