自主管理的保稅區儲物流企業，必須通過海關的嚴格審核才能營運。

保稅區儲區別于一般倉儲之處在于保稅區儲的力度要大得多。貨物在倉庫中的全周期需要能夠實時掌握，因此保稅區儲的管理信息系統要求也高很多。庫存信息化通過庫存物品的入庫、出庫、移動和盤點等操作對企業的物流進行全面的控制和管理，能夠降低庫存，減少資金占用，杜絕物料積壓與短缺現象，提高服務水平，保證生產經營活動的順利進行。
自主管理的保稅區儲物流企業，必須通過海關的嚴格審核才能營運。首先，自主管理的保稅區物流企業必須有很好的管理體系，還要有很好的誠信度，確保國家關稅的征收，決不，保稅貨物的物流過程必須符合中國海關管理規范，嚴格執行海關進出口報關規則；其次，自主管理的保稅區物流企業必須能為貨主提供高質量的、符合要求的物流服務，其中包括能嚴格按照貨主的要求進行備件的保管、存儲、包裝、配送、回收和退換，保證維修備件能正確、快捷、準時、保質地送達貨主手中。

2．保稅區儲貨物簡單加工
（1）保稅區庫申請對保稅區儲貨物進行改變包裝、分級分類、加刷嘜碼、分拆拼裝等簡 單加工，須事先填制《保稅區儲貨物簡單加工申請表》向主管海關提出。
（2）主管海關審核后，在《保稅區儲貨物簡單加工審核表》“海關審核意見”欄批注是否準予開展簡單加工業務的意見，并簽發給企業。
（3）保稅區庫須在對倉儲貨物簡單加工完成后3個工作日內，在《保稅區儲貨物簡單加工審核表》加注加工情況，交回主管海關。
3．保稅區儲貨物存放期限
（1）保稅區儲貨物儲存期限為一年，儲存期限滿后，有正當理由的，可向主管海關申請延期，延期長不得超過一年。
（2）辦理延期手續應遞交單證：
a．延期倉儲協議；
b．《保稅區儲貨物延期倉儲申請表》。
（3）經海關審核準予延期的，海關簽發《保稅區儲貨物延期倉儲審核表》。
（4）對超過規定的存儲期限三個月仍不復運出境，也不辦理有關進境手續的，海關依法變賣處理。

加快了通關速度。此種管理模式特別適用于對時間和庫存要求比較高的維修備件的保稅庫存業務。
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